Nemocnica v Trstenej prešla od konca 20. storočia významnými zmenami, ktoré reflektovali nielen celospoločenské udalosti po roku 1989, ale aj potrebu modernizácie a optimalizácie zdravotníckej starostlivosti na Orave.
Transformácia po roku 1989
Rok 1989 predstavoval začiatok zásadných sociálno-politických a hospodárskych zmien, ktoré sa výrazne dotkli aj slovenského zdravotníctva. Kľúčovým míľnikom bol rok 1991, kedy zanikol OÚNZ Dolný Kubín a existujúce nemocnice v Dolnom Kubíne, Trstenej a Námestove sa osamostatnili.
V tomto období nemocnica investovala do rozvoja infraštruktúry:
- V máji 1991 bola dokončená rekonštrukcia a prístavba kuchyne a jedálne pre zamestnancov.
- V rokoch 1992 - 1993 prebehla modernizácia kanalizačnej siete a generálna oprava strechy hlavného pavilónu.
- Na rozhraní rokov 1994 - 1995 sa zaviedlo plynové vykurovanie celého komplexu.
- V roku 1995 pribudla na južnom dvore kyslíková stanica.

Zmeny v kapacitách a nové oddelenia
Vývoj počtu lôžok a štruktúry oddelení kopíroval meniace sa potreby regiónu. Ešte v roku 1988 sa začali stavebné práce na novom pavilóne oddelenia TaRCH, ktorý bol daný do užívania koncom roka 1991. K 1. júlu 1994 rozhodlo Ministerstvo zdravotníctva o znížení stavu lôžok na 310. V roku 1996 sa v dôsledku nového územno-správneho členenia stala Nemocnica s poliklinikou (NsP) Trstená jediným lôžkovým zariadením v novovytvorenom okrese Tvrdošín.
Ďalší rozvoj priniesol nové špecializované pracoviská:
- V roku 1997 vzniklo po rekonštrukcii pôvodného pavilónu TaRCH psychiatrické oddelenie s CPLDZ (kapacita 40 lôžok).
- Vo februári 1998 bolo otvorené anesteziologicko-resuscitačné oddelenie (ARO).
- Od 1. júla 2000 sa otvorilo doliečovacie oddelenie s 20 lôžkami.
Nemocnica - 1. epizóda (dokumentárny film) | Naše príbehy
Súčasný stav a modernizácia
V októbri 2000 sa začala rozsiahla prístavba a rekonštrukcia ARO, v rámci ktorej vznikli nové výťahy pre ORL, gynekologicko-pôrodnícke, interné a chirurgické oddelenie, ako aj spojovacia chodba v podkroví. Nemocnica sa postupne stabilizovala v rozsahu poskytovanej zdravotnej starostlivosti, vrátane urgentných služieb.
| Obdobie | Významná udalosť |
|---|---|
| 1991 | Osamostatnenie NsP Trstená |
| 1997 | Vznik psychiatrického oddelenia |
| 2000 | Transformácia lôžkového fondu |
| 2011 | Zrušenie oddelení ORL a TaRCH, prechod na jednodňovú starostlivosť |
K 1. decembru 2011 došlo k ďalšiemu poklesu lôžok (na súčasných 272) v dôsledku zrušenia oddelení ORL a TaRCH. Tieto kapacity však boli transformované do jednodňovej a stacionárnej starostlivosti, čím si nemocnica udržala svoju dôležitú rolu v regióne.